220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1558 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  100 
 
 
295 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  66.1 
 
 
295 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  45.86 
 
 
297 aa  296  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  43.49 
 
 
294 aa  281  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  41.16 
 
 
294 aa  249  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  38.78 
 
 
287 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  36.03 
 
 
291 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  36.84 
 
 
291 aa  202  8e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  36.08 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  35.69 
 
 
291 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  34.39 
 
 
293 aa  176  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  37.92 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  30.03 
 
 
289 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  33.91 
 
 
286 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  35.71 
 
 
287 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  35.23 
 
 
286 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  34.88 
 
 
286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  34.52 
 
 
286 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  34.88 
 
 
286 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  34.88 
 
 
286 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  34.52 
 
 
286 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  34.52 
 
 
286 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  34.52 
 
 
286 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  34.52 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  34.16 
 
 
286 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  33.22 
 
 
281 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  34.16 
 
 
286 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  33.45 
 
 
286 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  33.69 
 
 
287 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  30.93 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  28.98 
 
 
293 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  27.3 
 
 
308 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  30.17 
 
 
309 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  29.76 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  28.52 
 
 
309 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.07 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  29.89 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  28.87 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  29.76 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  29.76 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  29.93 
 
 
285 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.88 
 
 
281 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  28.92 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  31.56 
 
 
281 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  27.21 
 
 
287 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.45 
 
 
283 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.72 
 
 
281 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  29.15 
 
 
282 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  26.21 
 
 
280 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  25.52 
 
 
280 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  25.52 
 
 
280 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  25.52 
 
 
287 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  25.52 
 
 
287 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  25.52 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  25.17 
 
 
287 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  26.78 
 
 
303 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  24.83 
 
 
280 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.17 
 
 
282 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  29.37 
 
 
288 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  25.26 
 
 
342 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  28.72 
 
 
281 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.52 
 
 
280 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  26.95 
 
 
288 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  24.91 
 
 
285 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  27.55 
 
 
292 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  25.34 
 
 
282 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  25.34 
 
 
282 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  29.01 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.66 
 
 
280 aa  99  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  26.26 
 
 
299 aa  99  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  27.43 
 
 
292 aa  99  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  25.86 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  26.86 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  26.37 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  26.98 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.05 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  26.69 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  26.6 
 
 
280 aa  95.9  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  25.17 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  27.17 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  26.69 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  27.08 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  26.74 
 
 
282 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.32 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  26.43 
 
 
282 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  26.24 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.7 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  26.39 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  27.17 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  26.45 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  28.97 
 
 
833 aa  89.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  26.48 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  25.62 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.34 
 
 
279 aa  89  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  25.35 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  25.35 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  27.7 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  26.41 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  25.62 
 
 
280 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  25.62 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>