233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0301 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  100 
 
 
283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  99.29 
 
 
283 aa  560  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  42.2 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  40.57 
 
 
283 aa  228  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16150  hypothetical protein  38.35 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  35.11 
 
 
279 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1149  degV family protein  35.13 
 
 
300 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.286505  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  36.75 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  35.44 
 
 
283 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  35.23 
 
 
282 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  34.29 
 
 
301 aa  156  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.56 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.83 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  32.37 
 
 
284 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30.56 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30.56 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.12 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.93 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.12 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.96 
 
 
280 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  34.62 
 
 
280 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.12 
 
 
280 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.77 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  32.63 
 
 
277 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.77 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.77 
 
 
280 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  32.87 
 
 
282 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.77 
 
 
280 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  33.45 
 
 
292 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.72 
 
 
280 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.01 
 
 
281 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  30.56 
 
 
282 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  30.56 
 
 
282 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  34.64 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.58 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  31.65 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  36.59 
 
 
284 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.77 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  30.18 
 
 
293 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  31.18 
 
 
279 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  32.01 
 
 
285 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  29.29 
 
 
285 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  31.07 
 
 
279 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.5 
 
 
280 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.47 
 
 
280 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  30.11 
 
 
281 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.07 
 
 
279 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  32.75 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.75 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.23 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  31.67 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  33.21 
 
 
279 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.96 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  32.4 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  32.17 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  30.85 
 
 
271 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  32.04 
 
 
279 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  31.83 
 
 
285 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  30.07 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  33.57 
 
 
279 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  30.8 
 
 
292 aa  136  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  26.76 
 
 
287 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  31.32 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.9 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  32.38 
 
 
288 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  29.68 
 
 
303 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.6 
 
 
280 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  32.38 
 
 
288 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  30.88 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.47 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  33.68 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.01 
 
 
299 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  30.53 
 
 
286 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  30.18 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  30.18 
 
 
286 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  30.18 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  30.18 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  30.18 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  30.42 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.18 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  31.1 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.82 
 
 
286 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.97 
 
 
286 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  30.5 
 
 
297 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  32.64 
 
 
279 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  27.7 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  29.08 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  31.82 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  30.88 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.83 
 
 
282 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  25.63 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  30.48 
 
 
326 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  29.43 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>