231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16150  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  606  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1149  degV family protein  50 
 
 
300 aa  275  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.286505  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  42.07 
 
 
301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  38.35 
 
 
283 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  38.35 
 
 
283 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  34.04 
 
 
285 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  32.16 
 
 
283 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.61 
 
 
279 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.27 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  34.49 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.47 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.31 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  27.94 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  30.66 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  29.52 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.37 
 
 
280 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.72 
 
 
280 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.72 
 
 
280 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.72 
 
 
287 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.72 
 
 
287 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.37 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.37 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.71 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.88 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  29.02 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.87 
 
 
282 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.87 
 
 
282 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.78 
 
 
280 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.47 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.42 
 
 
281 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  28.62 
 
 
282 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  27.73 
 
 
293 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  28.47 
 
 
280 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  28.03 
 
 
280 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  28.47 
 
 
280 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  27.73 
 
 
292 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  29.45 
 
 
281 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  29.57 
 
 
303 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.31 
 
 
280 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.03 
 
 
280 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  30.36 
 
 
281 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  31 
 
 
283 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  28.42 
 
 
281 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  27.8 
 
 
281 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  26.52 
 
 
282 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  26.18 
 
 
280 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.57 
 
 
282 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.57 
 
 
280 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.57 
 
 
280 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.57 
 
 
280 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.19 
 
 
280 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  31.19 
 
 
280 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  30.43 
 
 
287 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  28.11 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.21 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  26.12 
 
 
290 aa  99  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  32.17 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  26.98 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  26.57 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  28.67 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.47 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.28 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  24.48 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  26.67 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  26.67 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  25.54 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  28.12 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  26.24 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  25.89 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.36 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  26.32 
 
 
287 aa  92.8  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  25.53 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  25.53 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  25.53 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  25.53 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  25.8 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  29.37 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  26.15 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  26.26 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  27.24 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  26.06 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  25.81 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1178  DegV family protein  29.29 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000234319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.17 
 
 
282 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  25.18 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  26.95 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  26.09 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  26.95 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.97 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  30.11 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  25.76 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  25.72 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  26.91 
 
 
279 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  26.91 
 
 
279 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  29.77 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  31.83 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  32.89 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  26.33 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  25 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>