240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1292 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  100 
 
 
286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  50.18 
 
 
279 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  48.19 
 
 
279 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  37.72 
 
 
279 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  34.07 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  35.74 
 
 
280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  34.8 
 
 
299 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  34.98 
 
 
283 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  36.56 
 
 
280 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  38.95 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  37.19 
 
 
279 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  36.3 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  37.89 
 
 
279 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  36.3 
 
 
279 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  35.71 
 
 
280 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  38.39 
 
 
282 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  38.18 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  42.91 
 
 
284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  37.89 
 
 
279 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  34.31 
 
 
280 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  40.21 
 
 
296 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  43.46 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  42.99 
 
 
286 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  39.29 
 
 
271 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  39.07 
 
 
282 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  32.5 
 
 
281 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  36.75 
 
 
283 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  37.59 
 
 
287 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  35.82 
 
 
275 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  36.65 
 
 
284 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  36.46 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.48 
 
 
280 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.48 
 
 
280 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.48 
 
 
287 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.48 
 
 
287 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  32.48 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  33.93 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.48 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  33.33 
 
 
282 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  32.62 
 
 
290 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  35.13 
 
 
280 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  31.82 
 
 
282 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.75 
 
 
287 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  36.79 
 
 
282 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  33.69 
 
 
281 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.75 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  37.1 
 
 
279 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  31.14 
 
 
303 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  36.82 
 
 
279 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  37.12 
 
 
280 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  32.98 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  32.25 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  32.25 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  35.71 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  31.93 
 
 
283 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  32.62 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.66 
 
 
279 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  32.27 
 
 
293 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.66 
 
 
279 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  34.51 
 
 
281 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  29.72 
 
 
311 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  31.23 
 
 
283 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  34.16 
 
 
637 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.04 
 
 
283 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  30.6 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.6 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  35.62 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  32.28 
 
 
285 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  32.97 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  30.6 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  29.47 
 
 
280 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  33.49 
 
 
281 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  29.47 
 
 
280 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  33.93 
 
 
282 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  36.55 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.18 
 
 
280 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  29.43 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  29.93 
 
 
833 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  30.88 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  27.53 
 
 
292 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.39 
 
 
280 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  33.69 
 
 
683 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  35.79 
 
 
286 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  32.64 
 
 
293 aa  129  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  30.56 
 
 
287 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  29.12 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  29.12 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  29.12 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  31.67 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  31.21 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  32.57 
 
 
281 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  30.36 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.9 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  29.12 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1395  degV family protein  34.16 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  29.12 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  29.68 
 
 
280 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  28.77 
 
 
280 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  30.18 
 
 
279 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>