232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2272 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  547  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  53.55 
 
 
284 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  53.93 
 
 
283 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  52.52 
 
 
280 aa  234  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  45.82 
 
 
283 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  53.62 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  52.17 
 
 
284 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  48.55 
 
 
326 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  47.1 
 
 
279 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  48.21 
 
 
280 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  50 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  44.1 
 
 
297 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  52.16 
 
 
286 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  43.9 
 
 
331 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  37.55 
 
 
281 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  35.77 
 
 
279 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  35.77 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  40.21 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  34.75 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  35.92 
 
 
279 aa  161  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  35.04 
 
 
279 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  39.78 
 
 
282 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  36.65 
 
 
281 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  42.36 
 
 
285 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  36.82 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  34.77 
 
 
280 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  34.77 
 
 
280 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.64 
 
 
281 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  34.66 
 
 
280 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  34.67 
 
 
280 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  35.02 
 
 
280 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  35.02 
 
 
280 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  37.81 
 
 
286 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  35.51 
 
 
279 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  34.66 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  34.66 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  34.66 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  42.81 
 
 
324 aa  149  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  34.63 
 
 
283 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  34.89 
 
 
284 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  34.66 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  34.53 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.63 
 
 
299 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  36 
 
 
279 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.9 
 
 
281 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  34.55 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  31.75 
 
 
282 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  34.53 
 
 
280 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  39.48 
 
 
322 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  35.25 
 
 
280 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  30.85 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  31.47 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  31.12 
 
 
283 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  29.96 
 
 
281 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  29.6 
 
 
281 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.85 
 
 
280 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.82 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  33.33 
 
 
279 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  30.53 
 
 
284 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  35.66 
 
 
282 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.82 
 
 
280 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  32.38 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  45.13 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  33.45 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  36.69 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  36.69 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  33.09 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  33.09 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  33.09 
 
 
287 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  33.09 
 
 
287 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  36.82 
 
 
278 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  40.07 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  32.62 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  37.24 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  38.03 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.8 
 
 
279 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  32.85 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  32.85 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  32.5 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  30.85 
 
 
287 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.2 
 
 
282 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  34.53 
 
 
282 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  33.7 
 
 
277 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.71 
 
 
286 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  30.56 
 
 
833 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  32.16 
 
 
286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  32.14 
 
 
286 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.79 
 
 
286 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  31.79 
 
 
286 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  32.14 
 
 
286 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  31.79 
 
 
286 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  31.79 
 
 
286 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  31.79 
 
 
286 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  35.25 
 
 
275 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  29.39 
 
 
293 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  31.49 
 
 
282 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  36.36 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>