232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2384 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  64.34 
 
 
276 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  35.02 
 
 
279 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  34.53 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  32.59 
 
 
282 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  35.82 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  33.09 
 
 
280 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  33.45 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.79 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  32.5 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.1 
 
 
287 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.65 
 
 
279 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  29.39 
 
 
279 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  32.01 
 
 
287 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  32.5 
 
 
279 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.77 
 
 
299 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.94 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  32.84 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.58 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.94 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.94 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.94 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.94 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  30.82 
 
 
282 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  30.82 
 
 
282 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.7 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  29 
 
 
279 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  34.89 
 
 
282 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  29 
 
 
279 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  37.21 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.88 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  31.86 
 
 
833 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  35.44 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  30.88 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  30.55 
 
 
637 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  37.9 
 
 
286 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  34.42 
 
 
326 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  29.03 
 
 
311 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  29.39 
 
 
310 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.67 
 
 
287 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  32.97 
 
 
280 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.78 
 
 
281 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  28.83 
 
 
277 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  32.62 
 
 
279 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  35.42 
 
 
296 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.57 
 
 
281 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  29.6 
 
 
282 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  28.32 
 
 
311 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1395  degV family protein  30.4 
 
 
280 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.17 
 
 
283 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.18 
 
 
282 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.8 
 
 
280 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.97 
 
 
287 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  30.74 
 
 
279 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  31.38 
 
 
282 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  26.18 
 
 
281 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  30.47 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.05 
 
 
285 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  28.16 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  31.25 
 
 
271 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  32.03 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.58 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  28.06 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  31.54 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  26.88 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.73 
 
 
280 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  26.01 
 
 
279 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  27.27 
 
 
297 aa  98.6  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  26.45 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  29.72 
 
 
288 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  26.69 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  30.04 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  29.72 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  27.44 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  26.76 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2726  degV family protein  27.88 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.131746  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  32.62 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  33.07 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  30.63 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2472  degV family protein  27.88 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00728292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2671  degV family protein  27.88 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000678486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2436  hypothetical protein  27.88 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2398  hypothetical protein  27.88 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.419302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2653  degV family protein  27.88 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2628  degV family protein  27.51 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108949  decreased coverage  0.000000230039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2683  degV family protein  28.31 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  25.64 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.92 
 
 
284 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.01 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  27.6 
 
 
281 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  24.91 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.88 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  28.47 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  28.83 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  28.36 
 
 
604 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.08 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2481  DegV family protein  27.14 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  27.96 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.76 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>