227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3470 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  100 
 
 		 286 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  86.32 
 
 		 286 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  57.65 
 
 		 326 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  58.24 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  53.93 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  53.19 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  54.55 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  51.09 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  45.94 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  43.62 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  44.33 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  44.65 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  43.57 
 
 		 278 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  43.57 
 
 		 278 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  43.57 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.58 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  40.37 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  40.57 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  38.93 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  39.72 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  38.55 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  41.37 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  42.86 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  32.75 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  32.51 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.47 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.71 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  35.27 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  40.42 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  41.08 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  34.71 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  34.64 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  34.29 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  35.11 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  39.79 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  33.21 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  33.45 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.9 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  39.86 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  33.93 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  35.19 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  37.55 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  32.98 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.68 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  30.74 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.28 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  32.98 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  33.21 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  31.29 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.29 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.18 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  33.56 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.01 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.61 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  32.86 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  35.25 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30.58 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30.58 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.53 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  40.71 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  32.75 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.05 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.89 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  35.59 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  31.34 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  29.89 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  33.81 
 
 		 637 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.26 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.26 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.26 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.26 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.26 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.33 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  35.97 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.88 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.88 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.07 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13260  degV family protein  48.19 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  28.83 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.77 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.79 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  30.04 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  30.04 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  44.6 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.4 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.47 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.29 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.6 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  28.36 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  31.43 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  31.43 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.5 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  33.7 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.01 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.01 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  29.18 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>