239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13260  degV family protein  100 
 
 		 298 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  50.18 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  48.2 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  45.85 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2233  degV family protein  47.24 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.956375  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  52.57 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  48.55 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  43.07 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  51.08 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  46.01 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  42.39 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  47.65 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  43.06 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  45.93 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  43.38 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  35.4 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.18 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  43.84 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.34 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  39.86 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  34.31 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  34.67 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  34.42 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  42.35 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  44.28 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.63 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  34.78 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.26 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.67 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.33 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  32.13 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.4 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  28.52 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  36.23 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.47 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.47 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.05 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.64 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.97 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.83 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  32.41 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  37.94 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  34.91 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  35.79 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  36.36 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  34.04 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.18 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  26.16 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  29.45 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  34.51 
 
 		 637 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  29.82 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  29.82 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  29.45 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.17 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  39.61 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  29.97 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  29.82 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  29.82 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  29.82 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.1 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  35.34 
 
 		 683 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.83 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.49 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  33.17 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  29.08 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  33.17 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  29.08 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  29.08 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  29.08 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  29.47 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  37.72 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  29.47 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  29.37 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  37.94 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  29.82 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.2 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  26.95 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.68 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  29.43 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  29.43 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.11 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  32.97 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  29.02 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  30.25 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.37 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.62 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  33.57 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  28.47 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.27 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.68 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  27.78 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  28.47 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  39.85 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  39.85 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.22 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>