229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3190 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  100 
 
 		 286 aa  567  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  47.83 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  47.83 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  47.83 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  47.92 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  47.25 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  41.79 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  45.83 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  41.73 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  42.6 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  39.51 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  38.71 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  37.94 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  39.03 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  41.3 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  34.66 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  42.26 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  37.46 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  30.85 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  34.66 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  35.79 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  29.37 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.32 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  30.47 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  30.82 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  29.6 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.87 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.87 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.03 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  31.69 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.58 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.29 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  38.21 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  30.74 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.52 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.21 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  29.64 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  36 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.56 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.1 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  26.18 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  26.18 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  31.6 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  32.5 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  28.57 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  34.77 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.02 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.38 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.99 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  28.27 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  30.25 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  28.03 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  28.98 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  27.92 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.86 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  25.09 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  29.93 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  33.1 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.4 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  31.02 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  28.03 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  32.86 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  29.11 
 
 		 637 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  28.03 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  26.33 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  27.4 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  30.58 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  24.73 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.33 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  28.57 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  27.4 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  28.91 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  30.22 
 
 		 683 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  29.12 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  25.17 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.37 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.14 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  39.93 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  26.52 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  26.62 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  27.96 
 
 		 604 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  30.56 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  31.85 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  28.42 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  23.13 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  31.47 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.21 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.21 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.21 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.21 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  28.32 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.21 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  27.86 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>