236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1267 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1267  degV family protein  100 
 
 		 311 aa  630  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  92.28 
 
 		 311 aa  587  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  88.75 
 
 		 310 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  41.37 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  41.37 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  41.01 
 
 		 279 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  41.94 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  40.43 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  40.86 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  37.32 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  35.87 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  35.51 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  34.3 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  34.3 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  35.97 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.77 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  32.49 
 
 		 279 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  34.3 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  33.21 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  33.57 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  32.49 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  33.57 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  31.85 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.07 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  31.23 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.6 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  34.04 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  31.18 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.96 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.25 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  29.93 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  32.21 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.1 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  30.53 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  33.92 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.14 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  33.45 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.5 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  30.07 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  30.22 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.14 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  29.86 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  29.9 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  29.86 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  29.86 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  30.39 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.22 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  29.86 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  30.47 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  29.5 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  31.05 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  31.18 
 
 		 833 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.63 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.32 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.46 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.99 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  29.72 
 
 		 286 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  29.04 
 
 		 279 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  28.99 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.9 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  29.86 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.87 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.87 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  30.58 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  29.78 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  27.64 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.71 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.64 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  29.41 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  29.58 
 
 		 604 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  27.34 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  29.2 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.97 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  28 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  30.29 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  31.82 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.23 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  27.64 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  27.64 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.81 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.81 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  27.64 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  27.64 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.36 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  27.27 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  30.42 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  28.72 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  28.47 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.21 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.17 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.64 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1430  degV family protein  28.32 
 
 		 827 aa  112  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  28.1 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>