228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_903 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_903  DegV  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  84.86 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  84.04 
 
 		 284 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.75 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0388  degV family protein  34.63 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  33.1 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  31.43 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  31.45 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.45 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.8 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  32.97 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  34.51 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.34 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.34 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.62 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.5 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.5 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.5 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.5 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  30.28 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.14 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.14 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  31.71 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.79 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.66 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  29.43 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  30.28 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  30.28 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  27.82 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  32.99 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.57 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.5 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  28.98 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  32.75 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.66 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  28.57 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.66 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  27.66 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.64 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  28.57 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  28.67 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.43 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  29.68 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  30.47 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  30.04 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.3 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.3 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.3 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  29.71 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.3 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  29.68 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.6 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.6 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  26.95 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  28.32 
 
 		 604 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  26.06 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  26.95 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  31.9 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.79 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.82 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  27.86 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  28.57 
 
 		 637 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  27.18 
 
 		 683 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.54 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  27.11 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.71 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.27 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  25.54 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.64 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  27.56 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  27.66 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  26.26 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.66 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  28.37 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  29.27 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.02 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.76 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.53 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  28.77 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  26.74 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  26.69 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  26.12 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  28.91 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  28.28 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.57 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  30.47 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  27.86 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  27.86 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  25 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  23.78 
 
 		 312 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  26.39 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  25.95 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  30.36 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>