231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1032 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1032  degV family protein  100 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  85.92 
 
 
285 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  84.04 
 
 
285 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.29 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0388  degV family protein  34.98 
 
 
294 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.16 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  30.53 
 
 
311 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  29.93 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.54 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.52 
 
 
280 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.08 
 
 
282 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  28.47 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  31.18 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  30.31 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  29.75 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.52 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.52 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.52 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.76 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.52 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.7 
 
 
283 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.7 
 
 
283 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  28.77 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  29.18 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.17 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  29.54 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.17 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  29.54 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  29.54 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  29.54 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  29.54 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.18 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  29.54 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  32.04 
 
 
282 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.82 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  29.18 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  28.27 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  28.52 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.32 
 
 
282 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.32 
 
 
282 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.32 
 
 
280 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  29.47 
 
 
311 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  31.14 
 
 
283 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  27.21 
 
 
303 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.77 
 
 
293 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  29.47 
 
 
310 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  28.07 
 
 
280 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.18 
 
 
286 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  28.07 
 
 
280 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  28.17 
 
 
280 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  28.87 
 
 
287 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  28.83 
 
 
286 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.34 
 
 
285 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.52 
 
 
284 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  28.52 
 
 
279 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.77 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.17 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.57 
 
 
282 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  26.5 
 
 
281 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.86 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.21 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  28.21 
 
 
287 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.9 
 
 
277 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  29.62 
 
 
291 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  30.18 
 
 
283 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  28.28 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  25.18 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.62 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  28.37 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.31 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  28.72 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  29.02 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.48 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  26.43 
 
 
281 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  27.82 
 
 
604 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  29.05 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  25.78 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  28.47 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  26.95 
 
 
637 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  30.47 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  28.47 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  26.57 
 
 
683 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  25.18 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.23 
 
 
282 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1178  DegV family protein  30.91 
 
 
278 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000234319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  27.97 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  25.18 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  29.39 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  26.5 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  24.21 
 
 
299 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  27.86 
 
 
286 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  26.07 
 
 
279 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  26.07 
 
 
279 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  28.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>