238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1037 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  100 
 
 
282 aa  568  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  41.7 
 
 
282 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  40.55 
 
 
299 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.77 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  38.24 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  37.13 
 
 
279 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  36.63 
 
 
279 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  33.8 
 
 
280 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  34.15 
 
 
280 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  34.15 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  34.15 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  34.15 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  34.15 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.45 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.75 
 
 
280 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  34.27 
 
 
282 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  34.27 
 
 
282 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  39.62 
 
 
279 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  34.16 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.32 
 
 
282 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  29.39 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.75 
 
 
280 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  38.39 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  34.6 
 
 
283 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  31.91 
 
 
279 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  32.04 
 
 
287 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  39.15 
 
 
280 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  31.77 
 
 
279 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.71 
 
 
279 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  28.67 
 
 
281 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  31.82 
 
 
281 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  35.48 
 
 
285 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  30.88 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.15 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  38.68 
 
 
833 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.71 
 
 
279 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.29 
 
 
280 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.71 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  33.93 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  31.69 
 
 
280 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.83 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.93 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  31.43 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.43 
 
 
280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  30.4 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  31.12 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.83 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  31.12 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  29.89 
 
 
281 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.43 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.43 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  29.68 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.05 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.07 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.07 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.07 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  31.05 
 
 
279 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  31.05 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  34.04 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.47 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  34.04 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.89 
 
 
284 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  30.69 
 
 
279 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.07 
 
 
280 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  30.34 
 
 
288 aa  125  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  29.71 
 
 
280 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  33.64 
 
 
279 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.64 
 
 
282 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.37 
 
 
283 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.8 
 
 
312 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  29.89 
 
 
282 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.9 
 
 
283 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  32.63 
 
 
284 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  28.67 
 
 
292 aa  123  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  27.86 
 
 
280 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30 
 
 
288 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  33.18 
 
 
279 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.56 
 
 
283 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  29.03 
 
 
285 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  29.64 
 
 
285 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  29.3 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  28.98 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  31.6 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  32.97 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  29.11 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  28.83 
 
 
282 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  28.72 
 
 
637 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.07 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  28 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  32.86 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  27.86 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  28 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  29.27 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  28.17 
 
 
278 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  30.22 
 
 
283 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  28.62 
 
 
289 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>