237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0603 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  90.07 
 
 		 282 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  59.22 
 
 		 284 aa  332  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  57.45 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  35.61 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  35.61 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  33.81 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  35.25 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  35.25 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  35.38 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  34.89 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  32.48 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  32.85 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.64 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  31.75 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  34.75 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  32 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  32.5 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  32.85 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  32.85 
 
 		 310 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  33.21 
 
 		 311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  34.06 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.69 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  31.27 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  30.36 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  33.09 
 
 		 281 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  30.29 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  36.2 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.39 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.29 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.71 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.21 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  29.71 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.69 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  31.67 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  28.32 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  28.32 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  28.62 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.51 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.54 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  29.96 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  28.52 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  26.35 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  24.37 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.88 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.88 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.11 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  24.01 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  25.87 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  26.46 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.7 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  29.12 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  26.86 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.86 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  27.27 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  25.71 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.08 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  26.64 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.12 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  26.71 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  26.71 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  26.62 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  24.13 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  26.79 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  27.14 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  27.66 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  27.14 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  27.14 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  27.66 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0388  degV family protein  27.62 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  27.14 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.06 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  27.21 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  25.62 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  23.13 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  28.62 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  26.33 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  24.91 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  24.55 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  24.91 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  24.19 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  24.19 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  24.19 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  24.19 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  24.19 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  24.19 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.21 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  29.35 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  26.43 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  29.09 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  30.31 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  23.47 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  23.83 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  30.93 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>