238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3239 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  79.72 
 
 
281 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  62.37 
 
 
280 aa  381  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  62.72 
 
 
280 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  61.29 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  61.29 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  61.29 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  61.29 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  60.93 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  61.29 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  61.29 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  60.93 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  60.93 
 
 
280 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  42.46 
 
 
292 aa  246  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  41.85 
 
 
288 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  39.26 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  39.26 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  40 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  39.78 
 
 
284 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  37.68 
 
 
295 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  38.27 
 
 
287 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  37.91 
 
 
280 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  37.91 
 
 
280 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  37.91 
 
 
287 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  37.91 
 
 
287 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  37.91 
 
 
280 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  37.91 
 
 
280 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  37.55 
 
 
280 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  37.63 
 
 
282 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  37.63 
 
 
282 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  36.75 
 
 
293 aa  188  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  37.55 
 
 
280 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  36.36 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  33.69 
 
 
313 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  34.51 
 
 
295 aa  182  7e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.04 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  36.56 
 
 
283 aa  178  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  36.52 
 
 
282 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  34.91 
 
 
282 aa  175  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  34.83 
 
 
279 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.58 
 
 
299 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  34.55 
 
 
282 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  34.49 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  37.59 
 
 
288 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  33.94 
 
 
277 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  36.88 
 
 
288 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  36.46 
 
 
287 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  32.14 
 
 
293 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  32.74 
 
 
279 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  38.1 
 
 
282 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  34.91 
 
 
285 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  30.94 
 
 
281 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  32.62 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  31.27 
 
 
279 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  31.27 
 
 
279 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  29.82 
 
 
282 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  34.74 
 
 
283 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  31.56 
 
 
279 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  32.01 
 
 
279 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  32.01 
 
 
279 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  29.79 
 
 
281 aa  148  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  31.01 
 
 
283 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.91 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.66 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.43 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.21 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.14 
 
 
280 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  33.45 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.77 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  31.21 
 
 
279 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  33.09 
 
 
279 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  34.41 
 
 
271 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  31.29 
 
 
282 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  30.94 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  32.36 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  33.94 
 
 
296 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  33.21 
 
 
281 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  33.68 
 
 
286 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  32.98 
 
 
286 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  32.86 
 
 
286 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.54 
 
 
281 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  33.68 
 
 
286 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  33.68 
 
 
286 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  33.68 
 
 
286 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  35.94 
 
 
291 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  33.68 
 
 
286 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  32.38 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  33.33 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  34.86 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  32 
 
 
281 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  33.82 
 
 
281 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  33.94 
 
 
280 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  34.63 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  31.29 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  32.64 
 
 
312 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  33.33 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  33.45 
 
 
284 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.89 
 
 
284 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>