243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0399 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  93.55 
 
 		 279 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  89.96 
 
 		 279 aa  489  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  57.14 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  55.76 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  55.4 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  45.59 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  45.26 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  44.53 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  45.26 
 
 		 279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  43.43 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  42.24 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  41.52 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  43.8 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  41.79 
 
 		 281 aa  228  9e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  40.43 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  41.07 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  41.99 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  40.29 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  36.53 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  40.14 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  45.29 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.82 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  32.85 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  34.55 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  37.14 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  36.4 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  40.73 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  36.46 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  36.63 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  32.27 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  34.17 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  36.26 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  40.21 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  35.04 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  38.95 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  34.53 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  34.77 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  34.77 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  35.9 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  36.75 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.01 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  35.36 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  30.51 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  34.94 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.73 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  33.69 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  35.87 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  32.97 
 
 		 283 aa  151  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  33.09 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  34.57 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  36 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  35.97 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  34.53 
 
 		 326 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.8 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  35.74 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  35.51 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  33.93 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  36.82 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  33.57 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.88 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  33.33 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.69 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  33.57 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  32.26 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  33.33 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  34.39 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.79 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  30.82 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  31.29 
 
 		 285 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.75 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.39 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  34.66 
 
 		 833 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  31.18 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  32.85 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  31.43 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  36.36 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  29.89 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.11 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  30.94 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.91 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  29.96 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  36.08 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  31.43 
 
 		 604 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  30.94 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  30.69 
 
 		 683 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  29.58 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  31.18 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  34.27 
 
 		 297 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.26 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  30.18 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  30.6 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.75 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  30.6 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>