242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1001 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  100 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  75.9 
 
 		 279 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  75.9 
 
 		 279 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1580  hypothetical protein  99.25 
 
 		 140 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  40.71 
 
 		 280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  41.07 
 
 		 287 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  41.07 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  41.07 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  41.07 
 
 		 287 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  41.07 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  40.71 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  40.78 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  40.78 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  40.71 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  39.64 
 
 		 280 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  38.01 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  37.15 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  36.46 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  36.56 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  31.18 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  35.13 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  32.23 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  32.01 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  35.05 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.73 
 
 		 280 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  33.69 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  31.64 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.82 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1178  DegV family protein  32.73 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000234319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  29.71 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.29 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.27 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.27 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  31 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  31.77 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  30.47 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  31.77 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.94 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  25.99 
 
 		 683 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.58 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.58 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  34.68 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  34.68 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  29.02 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.16 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0758  hypothetical protein  34.78 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.642534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  32.51 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  30.69 
 
 		 279 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  28.37 
 
 		 637 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.22 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  30.29 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  33.69 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  31.56 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.96 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.57 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.68 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  28 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  29.89 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  29.9 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  31.43 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.8 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.64 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  28.88 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.88 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  29.64 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  30.94 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  29.9 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.33 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  30.22 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.29 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  29.29 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  29.89 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  29.75 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  29.93 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  29.29 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  27.4 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.57 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  27.08 
 
 		 604 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  30.88 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  27.4 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  28.93 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  31.96 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  31.62 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  28.67 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  35.53 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  28.73 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.76 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.37 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  27.93 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  27.44 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.4 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  30.26 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>