240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1517 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  99.28 
 
 
279 aa  553  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  37.77 
 
 
290 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  35.79 
 
 
280 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  38.14 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  33.56 
 
 
287 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  33.56 
 
 
280 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  33.56 
 
 
280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  33.56 
 
 
287 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  33.56 
 
 
280 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  33.1 
 
 
280 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.68 
 
 
287 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  33.33 
 
 
280 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  33.33 
 
 
282 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  33.33 
 
 
282 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.76 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.72 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  34.27 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.58 
 
 
280 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  34.04 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  33.69 
 
 
279 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.19 
 
 
279 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.37 
 
 
312 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  32.86 
 
 
286 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  32.86 
 
 
286 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  32.86 
 
 
286 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  32.86 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  31.82 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  32.86 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  32.86 
 
 
286 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  32.51 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  34.57 
 
 
279 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  32.16 
 
 
286 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  33.22 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.12 
 
 
287 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  32.16 
 
 
286 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  31.1 
 
 
286 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  31.01 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  34.98 
 
 
281 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  35.51 
 
 
285 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  31.45 
 
 
283 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  33.09 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  33.81 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  31.97 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  30.63 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.98 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.39 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  33.1 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  37.85 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.7 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  32.5 
 
 
281 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  32.73 
 
 
279 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  34.98 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  32 
 
 
291 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  32.27 
 
 
279 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  33.5 
 
 
280 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.91 
 
 
291 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  29.24 
 
 
683 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.97 
 
 
293 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  33.18 
 
 
282 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  31.82 
 
 
279 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.96 
 
 
281 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  35.53 
 
 
282 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  31.37 
 
 
281 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  30.88 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  29.93 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  29.08 
 
 
279 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  30.18 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.87 
 
 
281 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  26.57 
 
 
637 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  29.47 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  34.52 
 
 
279 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  34.52 
 
 
279 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  31.07 
 
 
288 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  37.62 
 
 
283 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.48 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  29.79 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  33.03 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.7 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.21 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  32.07 
 
 
280 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  33.33 
 
 
292 aa  112  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  30.15 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  32.78 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  30.59 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  33.64 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  34.1 
 
 
282 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  27.14 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  31.86 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.65 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  32.61 
 
 
288 aa  109  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  24.1 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.22 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  29.01 
 
 
287 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  27.5 
 
 
281 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>