227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1216 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  100 
 
 
278 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  41.73 
 
 
277 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11340  DegV family protein  43.01 
 
 
279 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.56 
 
 
291 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  34 
 
 
285 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  31.77 
 
 
279 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.85 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.08 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.93 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.01 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  29.33 
 
 
286 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  28.62 
 
 
286 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.98 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.33 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  28.98 
 
 
286 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  29.58 
 
 
284 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.9 
 
 
280 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0028  hypothetical protein  29.5 
 
 
279 aa  122  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.27 
 
 
286 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  28.01 
 
 
280 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  26.24 
 
 
281 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.43 
 
 
280 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.43 
 
 
280 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.43 
 
 
287 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.43 
 
 
287 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.43 
 
 
280 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  27.76 
 
 
285 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.17 
 
 
303 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  30.6 
 
 
287 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.74 
 
 
280 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19210  hypothetical protein  28.78 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0436232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  27.14 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.25 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  28.78 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.22 
 
 
281 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  29.5 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  27.9 
 
 
282 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  30.22 
 
 
282 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  30.22 
 
 
282 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  30.59 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  31.05 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  26.79 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.77 
 
 
299 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  27.5 
 
 
281 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.24 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  25.89 
 
 
292 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  27.65 
 
 
291 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.54 
 
 
282 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.06 
 
 
282 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  29.29 
 
 
279 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  29.29 
 
 
279 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  23.43 
 
 
292 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  25.53 
 
 
286 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  28.52 
 
 
288 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  25.98 
 
 
286 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  25.45 
 
 
280 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  27.1 
 
 
289 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  26.92 
 
 
291 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.55 
 
 
290 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  24.73 
 
 
280 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  26.98 
 
 
293 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.7 
 
 
282 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  31.98 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  28.98 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  25.56 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.03 
 
 
279 aa  99  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  26.27 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  24.82 
 
 
604 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  28.57 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  29.23 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  27.96 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  29.82 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  29.18 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  25.18 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  29.23 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  22.14 
 
 
683 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  24.48 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  25.09 
 
 
281 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  24.23 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  25.21 
 
 
637 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  27.35 
 
 
279 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  22.74 
 
 
281 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  23.67 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  27.21 
 
 
288 aa  92.8  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  25.44 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  22.78 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.02 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  27.5 
 
 
278 aa  92  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  23.17 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  22.39 
 
 
284 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  30.18 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  26.96 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.3 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  25.61 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  25.89 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  23.13 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>