224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3344 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  41.73 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11340  DegV family protein  36.92 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.64 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0028  hypothetical protein  32.73 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  31.52 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  30.74 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  26.74 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  30.74 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  30.74 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  30.74 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  30.74 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.43 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.39 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19210  hypothetical protein  29.86 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0436232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.55 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  27.4 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.86 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  29.89 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  30.04 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.77 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  30.04 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  25.64 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  25.27 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.72 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  29.43 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  31.33 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  32.79 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  26.83 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  26.74 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  29 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  26.76 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.38 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.15 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  27.24 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  25.09 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  27.3 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  28.47 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.38 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.38 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  26.69 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  29.18 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  27.61 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  29.08 
 
 		 291 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  30.73 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  25 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.57 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  26.76 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  25 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  26.35 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.7 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.12 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.15 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  26.95 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  24.91 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  29.03 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.05 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  26.26 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  27.54 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  27.08 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  26.62 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  26.26 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  26.26 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  26.26 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  26.26 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30.61 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  27.56 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  27.24 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  29.51 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  27.78 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  26.2 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.84 
 
 		 282 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  24.32 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  25.18 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  26.07 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  26.07 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  25.76 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  25.18 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  26.5 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  26.36 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  24.91 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  25 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  26.5 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  25.35 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  23.49 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  24.63 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  28.37 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  28.84 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  25.79 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  25.36 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  27.6 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  26.85 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  27.84 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  25.8 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  23.05 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  25.62 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  24.72 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>