234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2314 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  100 
 
 
312 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.82 
 
 
280 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.14 
 
 
290 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  34.47 
 
 
280 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.47 
 
 
279 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.82 
 
 
280 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  30.88 
 
 
280 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  31.47 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  31.47 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  31.47 
 
 
280 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  31.47 
 
 
280 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.12 
 
 
287 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  31.93 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  34.51 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  33.79 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  31.69 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.77 
 
 
280 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  32.87 
 
 
287 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  33.57 
 
 
287 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.25 
 
 
282 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.25 
 
 
282 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  32.39 
 
 
281 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.82 
 
 
286 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  32.17 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.39 
 
 
280 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  29.37 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  29.37 
 
 
279 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  29.37 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.94 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  33.56 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  32.28 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.53 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.94 
 
 
286 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  32.75 
 
 
286 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.64 
 
 
281 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  31.72 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.94 
 
 
286 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  31.94 
 
 
286 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  31.6 
 
 
286 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  31.6 
 
 
286 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  31.6 
 
 
286 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  30.56 
 
 
281 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  31.6 
 
 
286 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.18 
 
 
279 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  34.89 
 
 
288 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.4 
 
 
282 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  34.89 
 
 
288 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.18 
 
 
279 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  28.16 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  34.08 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  31.01 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  31.01 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  32.39 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.97 
 
 
282 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.17 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  30.34 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.67 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  33.62 
 
 
295 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.01 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  30.07 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.82 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  30.48 
 
 
285 aa  126  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  31.71 
 
 
283 aa  125  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  31.34 
 
 
282 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  30.58 
 
 
313 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  28.33 
 
 
291 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  29.41 
 
 
310 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  28.87 
 
 
280 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.8 
 
 
282 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  28.12 
 
 
279 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  31.6 
 
 
283 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.67 
 
 
282 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  30.3 
 
 
637 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  29.59 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.93 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.62 
 
 
280 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  28.72 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  26.62 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  27.18 
 
 
280 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  28.62 
 
 
287 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  26.83 
 
 
283 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  31.8 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  27.97 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  29.62 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  30.2 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  28.72 
 
 
279 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  29.17 
 
 
279 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.82 
 
 
279 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  26.76 
 
 
285 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  27.92 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  29.17 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  30.58 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  27.21 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  31.12 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.57 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.57 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  29.83 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  27.74 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  25.87 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  26.76 
 
 
280 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>