240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_116 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  97.49 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  94.27 
 
 		 279 aa  546  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  55.4 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  53.6 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  52.88 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  44 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  44 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  42.91 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  41.37 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  41.73 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  41.37 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  41.37 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  41.22 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  42.65 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  41.42 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  40.29 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  37.18 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  39.93 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  40.14 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  39.79 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  40.43 
 
 		 276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  35.25 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  36.88 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  39.64 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  34.53 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  36.73 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  37.63 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  37.45 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  38.08 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  34.63 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  36.79 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  32.14 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  33.7 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  34.89 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  33.93 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  34.16 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.62 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  33.7 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  32.49 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  35.46 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  34.06 
 
 		 279 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  36.07 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.77 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  36.23 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  31.43 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  35.23 
 
 		 637 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.21 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  35.77 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  36.3 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  31.36 
 
 		 303 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.05 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  33.22 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  34.53 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  32.61 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  34.53 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  34.8 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  32.98 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.05 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  31.56 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.98 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  30.32 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  31.07 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.69 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.69 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.69 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  37.23 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.69 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.82 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  31.93 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  32.04 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.29 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  32.98 
 
 		 604 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  33.45 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  32.04 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  33.45 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  32.62 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  30.47 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  30.47 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.58 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  31.05 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>