240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1370 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  100 
 
 
271 aa  532  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  36.43 
 
 
279 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  33.1 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  37.83 
 
 
277 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  37.05 
 
 
279 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  33.82 
 
 
282 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  38.41 
 
 
282 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  35.25 
 
 
279 aa  158  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.26 
 
 
280 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  32.26 
 
 
281 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  36.07 
 
 
281 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  34.55 
 
 
283 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  35.25 
 
 
279 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  34.41 
 
 
281 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  35.25 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  33.45 
 
 
280 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  33.58 
 
 
281 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  34.64 
 
 
281 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  38.52 
 
 
282 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  35.02 
 
 
279 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  34.4 
 
 
288 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  33.57 
 
 
279 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  34.52 
 
 
279 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  34.52 
 
 
279 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  33.93 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  34.91 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  39.29 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.85 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.85 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  33.45 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  33.57 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  32.01 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  33.69 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  29.96 
 
 
282 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.64 
 
 
280 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.75 
 
 
282 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  31.64 
 
 
280 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.58 
 
 
280 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.39 
 
 
287 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.1 
 
 
279 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  35.79 
 
 
287 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.1 
 
 
279 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  31.41 
 
 
280 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  31.41 
 
 
280 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.02 
 
 
280 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28 
 
 
282 aa  142  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  31.41 
 
 
287 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  31.41 
 
 
287 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.58 
 
 
280 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  33.45 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  29.5 
 
 
280 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  32.6 
 
 
280 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.54 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.54 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.71 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  29.86 
 
 
280 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  29.86 
 
 
280 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  29.86 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  29.86 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  29.86 
 
 
280 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  30.74 
 
 
288 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  31.8 
 
 
288 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  30.74 
 
 
288 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  30.6 
 
 
286 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.36 
 
 
281 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  31.05 
 
 
280 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  29.5 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  29.5 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  29.14 
 
 
280 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  29.14 
 
 
280 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  36.07 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  32.85 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  30.99 
 
 
285 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.98 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  33.57 
 
 
280 aa  131  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  36.69 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  32.86 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  29.71 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.32 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  34.18 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  27.76 
 
 
285 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  30.22 
 
 
311 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.93 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  27.37 
 
 
292 aa  128  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.9 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  31.05 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.86 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  33.69 
 
 
288 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.27 
 
 
286 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  31.69 
 
 
286 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  28.27 
 
 
286 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  30.36 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  28.27 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  30.5 
 
 
291 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  30 
 
 
291 aa  126  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  32.62 
 
 
284 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  27.92 
 
 
286 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  27.92 
 
 
286 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  27.92 
 
 
286 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  27.92 
 
 
286 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>