233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0362 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  53.52 
 
 
288 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  50.7 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  51.06 
 
 
288 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.45 
 
 
279 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  31.07 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  34.98 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  30.42 
 
 
285 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  33.22 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  32.98 
 
 
280 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  32.04 
 
 
286 aa  122  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.99 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.99 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  33.22 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.99 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.99 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  32.64 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.51 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.96 
 
 
279 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  30.24 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.11 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.31 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.85 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  33.33 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.04 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  35.19 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  29.96 
 
 
288 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.02 
 
 
282 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  29.96 
 
 
288 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  32.76 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  32.76 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.03 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.85 
 
 
280 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.21 
 
 
284 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  33.22 
 
 
280 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  29.82 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.72 
 
 
282 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  27.3 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.07 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  27.11 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  26.95 
 
 
286 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  26.95 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  26.95 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  26.95 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  27.59 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.62 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  26.69 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.87 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.88 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  26.95 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  29.35 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.66 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.04 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.42 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.04 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.07 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  26.6 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  28.42 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  26.22 
 
 
282 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  26.6 
 
 
286 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  29.93 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  29.93 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.06 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.31 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.31 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.31 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  25.89 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.68 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.95 
 
 
281 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.93 
 
 
281 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.93 
 
 
283 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  29.9 
 
 
280 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  28.93 
 
 
290 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  29.97 
 
 
280 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  29.97 
 
 
280 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  30.87 
 
 
279 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  27.72 
 
 
291 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  30.54 
 
 
279 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  30.82 
 
 
277 aa  106  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  29.97 
 
 
280 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  28.93 
 
 
278 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  27.84 
 
 
281 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  29.37 
 
 
287 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  28.21 
 
 
286 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.17 
 
 
282 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  32.89 
 
 
279 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  27.84 
 
 
281 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  32.44 
 
 
279 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  30.59 
 
 
313 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  26.33 
 
 
292 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.55 
 
 
282 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  30.49 
 
 
295 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  27.4 
 
 
279 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  28.67 
 
 
279 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.76 
 
 
281 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  28.57 
 
 
285 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.43 
 
 
279 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.87 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  26.71 
 
 
285 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>