235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0171 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  100 
 
 
276 aa  552  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  64.34 
 
 
275 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  37.81 
 
 
279 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.04 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  33.82 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  33.58 
 
 
279 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.38 
 
 
279 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  33.21 
 
 
279 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.88 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  32.25 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.67 
 
 
287 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.8 
 
 
281 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  27.96 
 
 
279 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  27.96 
 
 
279 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.32 
 
 
287 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.32 
 
 
287 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.21 
 
 
282 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.32 
 
 
280 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.32 
 
 
280 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.21 
 
 
282 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  31.39 
 
 
280 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  27.96 
 
 
280 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.96 
 
 
280 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.93 
 
 
279 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.45 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  32.97 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  30.29 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  32.97 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  29.2 
 
 
311 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  29.56 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.08 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  32.36 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.93 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  31.9 
 
 
279 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  32.5 
 
 
293 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  28.78 
 
 
279 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  27.24 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.02 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.93 
 
 
280 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  28.83 
 
 
287 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.03 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  33.33 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  25.09 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.91 
 
 
282 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  29.56 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  31.18 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  29.45 
 
 
604 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  29.3 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  31.18 
 
 
279 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.87 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.96 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  27.21 
 
 
299 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.14 
 
 
282 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  31.2 
 
 
271 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.24 
 
 
290 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.67 
 
 
280 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.7 
 
 
280 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.7 
 
 
280 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.7 
 
 
280 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.96 
 
 
280 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.7 
 
 
280 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1395  degV family protein  29.78 
 
 
280 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  27.76 
 
 
282 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  28.42 
 
 
284 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  29.14 
 
 
833 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  27.34 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1100  degV family protein  33.09 
 
 
281 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144764  normal  0.0108361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  27.17 
 
 
281 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  26.81 
 
 
281 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.03 
 
 
281 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  27.34 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  28.17 
 
 
281 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  31.25 
 
 
283 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  35.77 
 
 
296 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  27.34 
 
 
280 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  27.34 
 
 
280 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.62 
 
 
283 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  29.54 
 
 
282 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  28.03 
 
 
295 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  30.53 
 
 
285 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  29.93 
 
 
637 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  32.62 
 
 
297 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  30.29 
 
 
279 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  26.71 
 
 
294 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  30.88 
 
 
279 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  29.23 
 
 
288 aa  102  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  30.26 
 
 
279 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  27.96 
 
 
292 aa  102  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30.12 
 
 
288 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  29.89 
 
 
281 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2472  degV family protein  26.86 
 
 
268 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00728292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2436  hypothetical protein  26.86 
 
 
268 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2398  hypothetical protein  26.86 
 
 
268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  27.17 
 
 
273 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2653  degV family protein  26.86 
 
 
268 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  27.56 
 
 
282 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  34.17 
 
 
286 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2671  degV family protein  26.86 
 
 
268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000678486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  30 
 
 
284 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  27.11 
 
 
289 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>