227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1100 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1100  degV family protein  100 
 
 
281 aa  547  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144764  normal  0.0108361 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.87 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  31.9 
 
 
279 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.69 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.85 
 
 
280 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  33.69 
 
 
279 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  28.37 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  33.45 
 
 
279 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  35.69 
 
 
283 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.32 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  32.13 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  31.9 
 
 
287 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  30.43 
 
 
281 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.04 
 
 
280 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  39.35 
 
 
280 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.79 
 
 
280 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  26.67 
 
 
299 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  30.47 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.82 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  31.05 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.11 
 
 
280 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  31.05 
 
 
279 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.11 
 
 
287 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.11 
 
 
280 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.11 
 
 
280 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.11 
 
 
287 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  32.73 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  28.94 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  32.62 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.82 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  34.48 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  35.74 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  30.32 
 
 
282 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  31.45 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.39 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  29.89 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  29.89 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  38.79 
 
 
284 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.14 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  30.42 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  32.63 
 
 
282 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  31.21 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  29.93 
 
 
310 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  30.32 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.11 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.42 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.63 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  30.11 
 
 
281 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  30.48 
 
 
279 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  37.41 
 
 
282 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  36.92 
 
 
284 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.72 
 
 
283 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.5 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  35.07 
 
 
297 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  29.26 
 
 
279 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  28.21 
 
 
311 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.07 
 
 
280 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  32.28 
 
 
279 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  28.98 
 
 
279 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  27.54 
 
 
279 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  27.54 
 
 
279 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  31.67 
 
 
282 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  28.01 
 
 
287 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  32.37 
 
 
275 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  28.26 
 
 
311 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  36.18 
 
 
326 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.92 
 
 
284 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.39 
 
 
280 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  27.3 
 
 
287 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30 
 
 
280 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30 
 
 
280 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  30.25 
 
 
287 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  27.11 
 
 
833 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  31.72 
 
 
288 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  30.36 
 
 
277 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  25.95 
 
 
281 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  38.08 
 
 
296 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.04 
 
 
280 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0615  DegV family protein  26.69 
 
 
282 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.04 
 
 
280 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.04 
 
 
280 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  27.72 
 
 
280 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  29.18 
 
 
280 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  29.18 
 
 
280 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  38.52 
 
 
280 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.57 
 
 
284 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  34.41 
 
 
281 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  29.68 
 
 
280 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  31.69 
 
 
292 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  37.37 
 
 
324 aa  99.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.52 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.04 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  25.95 
 
 
281 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  30.8 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  24.65 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  29.08 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  26.6 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  36.27 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  29.75 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  30.34 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>