231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0615 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0615  DegV family protein  100 
 
 
282 aa  567  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0322  DegV family protein  41.37 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  38.71 
 
 
273 aa  175  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.45 
 
 
279 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.73 
 
 
282 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0323  DegV family protein  33.21 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  33.21 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  32.87 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  33.68 
 
 
281 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  33.1 
 
 
280 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  34.16 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  32.25 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  31.45 
 
 
281 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.88 
 
 
279 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.77 
 
 
280 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  31.05 
 
 
279 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  31.67 
 
 
285 aa  112  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.07 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.16 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  30.69 
 
 
281 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  32.04 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  29.03 
 
 
280 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  29.82 
 
 
276 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  29.64 
 
 
281 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  28.64 
 
 
284 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.91 
 
 
286 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.12 
 
 
286 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.91 
 
 
286 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  29.6 
 
 
281 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  26.04 
 
 
282 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  32.75 
 
 
286 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  32.28 
 
 
286 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  32.28 
 
 
286 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  32.28 
 
 
286 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1271  DegV family protein  26.88 
 
 
278 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.724491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.56 
 
 
286 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  31.37 
 
 
279 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  31.25 
 
 
299 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  31.56 
 
 
286 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  32.28 
 
 
286 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  30.37 
 
 
279 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  30.55 
 
 
287 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  30.11 
 
 
277 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  28.32 
 
 
281 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  29.72 
 
 
285 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  27.56 
 
 
284 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.99 
 
 
281 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.25 
 
 
293 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  29.89 
 
 
286 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.54 
 
 
282 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  31.11 
 
 
279 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  29.63 
 
 
279 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  30.74 
 
 
279 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  27.02 
 
 
301 aa  99  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  30.82 
 
 
279 aa  99  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  28.52 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  24.29 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.94 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  31.54 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  25 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  27.17 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  30.82 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  27.34 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  30.82 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  28.94 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  27.9 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.82 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  28.26 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.82 
 
 
280 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0263  hypothetical protein  28.11 
 
 
595 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.18 
 
 
281 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0258  hypothetical protein  28.11 
 
 
595 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  27.82 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  24.82 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.11 
 
 
280 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.11 
 
 
280 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.55 
 
 
312 aa  92  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.11 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.11 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.25 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  29.43 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  28.31 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  27.84 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  27.34 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  26.91 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  27.13 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  25.27 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  29.71 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  29.1 
 
 
637 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  28.57 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.81 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  29.76 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  26.47 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  27.4 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  25.45 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  29.89 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  29.89 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  29.93 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  27.23 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  27.86 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>