206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0323 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0323  DegV family protein  100 
 
 		 285 aa  562  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  37.02 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0322  DegV family protein  32.1 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0615  DegV family protein  33.21 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0258  hypothetical protein  27.7 
 
 		 595 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0263  hypothetical protein  27.03 
 
 		 595 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.69 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.12 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.95 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  23.64 
 
 		 683 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  30.51 
 
 		 833 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  26.99 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.18 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.17 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  27.97 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1271  DegV family protein  26.97 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.724491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  28.77 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  26.39 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  29.2 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  25.87 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  26.92 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.26 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.26 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.26 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  29.74 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  29.74 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  27.97 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.26 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  29.74 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  28.82 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  29.74 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  27.42 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  26.99 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  26.83 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  26.62 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  26.83 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  26.02 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  22.71 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  26.15 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.43 
 
 		 303 aa  72  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0028  hypothetical protein  26.39 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  27.69 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  25.09 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  27.36 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  26.33 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  28.28 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  26.18 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  26.33 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0620  DegV family protein  23.18 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  25.51 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  26.18 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.53 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  28.87 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  25.81 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  25.26 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  25.25 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  27.21 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  25.81 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  27.59 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2481  DegV family protein  27.59 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  21.79 
 
 		 637 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  30.09 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2628  degV family protein  26.92 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108949  decreased coverage  0.000000230039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2726  degV family protein  27.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.131746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2472  degV family protein  27.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00728292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2436  hypothetical protein  27.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2398  hypothetical protein  27.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.419302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2653  degV family protein  27.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2683  degV family protein  26.54 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2671  degV family protein  27.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000678486 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  25.63 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.32 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.39 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  24.15 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  31.31 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  29.59 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  29.59 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  23.34 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  23.95 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  24.3 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  20.7 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  27.98 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.5 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.5 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.5 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  27.98 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.5 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  24.82 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  24.58 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  26.3 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  26.84 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  24.46 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  24.65 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  27.31 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.63 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.63 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.63 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  28.63 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  29.21 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.98 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>