236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2518 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  96.44 
 
 		 281 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  45.42 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  43.32 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  40.5 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  38.85 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.53 
 
 		 279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  31.77 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  35.23 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  32.76 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  30.31 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  32.06 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  33.81 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  31.21 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  31.82 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  30.58 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  32.49 
 
 		 280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.77 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.13 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.13 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.13 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.13 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  32.37 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.9 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.9 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  32.01 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.65 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  32.13 
 
 		 280 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.93 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  30.14 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.23 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  31.58 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  30.88 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  28.57 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.88 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  29.07 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  30.88 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  30.53 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  30.53 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  30.53 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  32.13 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  29.5 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.18 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  29.6 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  29.43 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.82 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  29.14 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  30.36 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.11 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  29.58 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.52 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.52 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  28.98 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  30.18 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  25.78 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.12 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.62 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  28.93 
 
 		 833 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  29.6 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  27.7 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  26.95 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  31.34 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  29.29 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  29.56 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  27.82 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  30.07 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.14 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  24.91 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  30.32 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  28.72 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  28.93 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.77 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.6 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.14 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  30.47 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  31.85 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  27.34 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  27.92 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  29.93 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  27.72 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  28.42 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  28.98 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  28.11 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.32 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  27.05 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  27.84 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  31.52 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0615  DegV family protein  29.64 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  27.14 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  26.57 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  28.67 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  26.81 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  26.43 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  33.94 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  27.5 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  28.92 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  30.5 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  25.98 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>