229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1656 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  50.18 
 
 		 282 aa  286  4e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  33.81 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  34.07 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  33.82 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  32.97 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  31.9 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  31.43 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  30.36 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  33.33 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  33.7 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  33.7 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.21 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.75 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  28.17 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  28.98 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  28.32 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  28.32 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.05 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  28.83 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.26 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  30.74 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.26 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  26.84 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.26 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  27.6 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.26 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  26.84 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  27.66 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.72 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.72 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  28.52 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  30.66 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  27.46 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  28.88 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.97 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  29.31 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  27.78 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  26.3 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30.69 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.92 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.92 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  30.77 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  27.3 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  26.64 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  27.82 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  26.97 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  27.15 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  26.45 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.01 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  29.58 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  29.68 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  32.71 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  28.97 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.57 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  27.08 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  25.27 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  25.53 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  26.69 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  28.42 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  26.64 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  26.43 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  26.15 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  28.16 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  27.64 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  27.05 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  26.6 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  26.22 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.76 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  26.48 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  25.27 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1149  degV family protein  26.09 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.286505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  27.99 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  25 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  27.01 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  26.73 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  25.87 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  26.55 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  26.55 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  25.36 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  26.33 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  25.34 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  26.21 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  25.45 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  23.53 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  27.21 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  27.5 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>