227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0322 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0322  DegV family protein  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0615  DegV family protein  41.37 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  42.07 
 
 
273 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0323  DegV family protein  32.1 
 
 
285 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.37 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  31.67 
 
 
282 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  30.43 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  30.91 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  28 
 
 
285 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  30.55 
 
 
293 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.99 
 
 
282 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  31.07 
 
 
286 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  30.43 
 
 
286 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  30.43 
 
 
286 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  30.43 
 
 
286 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  30.43 
 
 
286 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  30.18 
 
 
286 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  30.18 
 
 
286 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  30.59 
 
 
287 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.82 
 
 
282 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  30.04 
 
 
286 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.96 
 
 
279 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.96 
 
 
279 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.55 
 
 
286 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.89 
 
 
287 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  28.72 
 
 
287 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.14 
 
 
282 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.97 
 
 
281 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1271  DegV family protein  28.67 
 
 
278 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.724491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  27.05 
 
 
280 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  31.16 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  27.92 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.32 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.4 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  27.68 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.22 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  30.22 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  26.5 
 
 
282 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  30 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.45 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.18 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.85 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.66 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.27 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  30.43 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  27.08 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  29.6 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  29.93 
 
 
279 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  30.66 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.78 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.78 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  28.67 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.78 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  32.43 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  27.37 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.78 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  29.18 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  29.18 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  26.57 
 
 
277 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  30.81 
 
 
281 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  29.36 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  28.16 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  25.62 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  25.18 
 
 
311 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  26.62 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  26.6 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.07 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.12 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.57 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0263  hypothetical protein  30.41 
 
 
595 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.57 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.63 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  28.73 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  28.99 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  29.77 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.96 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0258  hypothetical protein  30.41 
 
 
595 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  25.79 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  26.64 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  23.93 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  27.44 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  23.93 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  28.12 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.31 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  27.21 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.75 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  25.09 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  22.58 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  25.97 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1080  hypothetical protein  26.1 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.670701  normal  0.358327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  25.53 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  26.37 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  26.69 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  29.25 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  28.84 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  27.6 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  29.41 
 
 
288 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  29.41 
 
 
288 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>