237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  100 
 
 		 279 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  54.71 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  47.1 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  39.86 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  41.01 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  42.76 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  44.24 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  42.7 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  41.94 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  43.32 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  38.87 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  41.94 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  34.04 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.39 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  44.98 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  32.5 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  32.14 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  32.64 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  34.66 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  32.29 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  32.14 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  32.26 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  36.84 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  36.62 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  32.14 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.43 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  31.07 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  37.14 
 
 		 331 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  38.57 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  29.23 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  33.92 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  33.57 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  29.54 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  29.63 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  37.72 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  32.37 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  32.17 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  34.04 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.66 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  32.01 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  31.49 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  33.82 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.96 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  29.64 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.47 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  32.85 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.64 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  34.98 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.49 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  33.1 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  33.33 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  31.07 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  30.94 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.45 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  28.21 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  29.47 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  28.11 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  29.43 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  29.93 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  28.67 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.17 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  30.74 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  28.57 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.47 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2216  degV family protein  36 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202222  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  30.47 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.17 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  30.47 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  27.46 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  30.47 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  29.82 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.03 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  27.46 
 
 		 833 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  28.17 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  32.62 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.21 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  29.89 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.42 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  27.92 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.92 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1178  DegV family protein  28.83 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000234319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  27.56 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  27.56 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  29.03 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  26.62 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  28.93 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  27.3 
 
 		 311 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  26.52 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.11 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.92 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.92 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.92 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  27.92 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  28.36 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  27.11 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  27.86 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  28.26 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.76 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.03 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  28.62 
 
 		 637 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>