87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1434 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 
367 aa  751    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  91.55 
 
 
367 aa  694    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  93.46 
 
 
367 aa  707    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  69.21 
 
 
367 aa  545  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  51.24 
 
 
370 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  48.23 
 
 
366 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.09 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  36.3 
 
 
408 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.38 
 
 
412 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  36.15 
 
 
408 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  30.77 
 
 
410 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.83 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.83 
 
 
375 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.1 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  24.56 
 
 
455 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.74 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  25.49 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  24.51 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  28.46 
 
 
454 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  24.51 
 
 
454 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  21.29 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  28.46 
 
 
454 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.74 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.01 
 
 
462 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  29.57 
 
 
455 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.4 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  23.02 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  23.02 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  29.17 
 
 
484 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.26 
 
 
380 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  31.91 
 
 
456 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  23.29 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  27.43 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  24.12 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  24.02 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  26.61 
 
 
455 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  32.65 
 
 
457 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  29.79 
 
 
455 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.81 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  21.58 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  22.64 
 
 
456 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  31.25 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.45 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  28.87 
 
 
454 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  23.64 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  21.53 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  22.01 
 
 
456 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  25.81 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.34 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  26.98 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  28.57 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.94 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.44 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  41.67 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  26.02 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  27.84 
 
 
454 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  35.21 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.1 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  27.37 
 
 
460 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  25.25 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  26.19 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  41.67 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  25.5 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  23.86 
 
 
456 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  22.64 
 
 
456 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  25.97 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.46 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  30.53 
 
 
457 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  29.29 
 
 
456 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  31.15 
 
 
379 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.1 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  25.25 
 
 
457 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  33.96 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  33.96 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.48 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  33.96 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.81 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  24.49 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  21.4 
 
 
383 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  39.58 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  29.51 
 
 
379 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.9 
 
 
379 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  25.13 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  25.13 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  20.38 
 
 
384 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  27.66 
 
 
456 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  23.08 
 
 
457 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>