126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3126 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  100 
 
 		 462 aa  941    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  39.74 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  38.98 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  37.67 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  38.03 
 
 		 454 aa  282  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  38.62 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  38.81 
 
 		 465 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  39.43 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  38.39 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  38.77 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  37.44 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  38.71 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  38.08 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  37.87 
 
 		 456 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  37.19 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  37.09 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  39.04 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  38.72 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  38.16 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  37.64 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  37.84 
 
 		 456 aa  263  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  36 
 
 		 456 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  37.19 
 
 		 456 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  36.89 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  35.79 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  35.76 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  34.44 
 
 		 457 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  36.75 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  34.73 
 
 		 456 aa  256  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  33.93 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  34.21 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  35.71 
 
 		 459 aa  253  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  35.93 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  37.72 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  38.86 
 
 		 457 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  34.75 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  38.89 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  36.38 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  37.33 
 
 		 452 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  38.08 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  38.22 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  35.84 
 
 		 454 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  36.05 
 
 		 460 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  36.1 
 
 		 453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  37.5 
 
 		 453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  31.96 
 
 		 484 aa  240  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  34.45 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  33.93 
 
 		 457 aa  239  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  37.25 
 
 		 453 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  34.73 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  36.74 
 
 		 460 aa  236  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  37.14 
 
 		 456 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  36.09 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  35.55 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  37.39 
 
 		 454 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  32.74 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  30.98 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.97 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  29.35 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  25.2 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.39 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.53 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  32.27 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  31.57 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.8 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  33.02 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  34.34 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  28.65 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.21 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  33.12 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.84 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.96 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.16 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.16 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.16 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.09 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.95 
 
 		 502 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.44 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.43 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  30.93 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.89 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.17 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  32.35 
 
 		 865 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  27.23 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.98 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.11 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.11 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.66 
 
 		 382 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  24.3 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.46 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.56 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  25.99 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  29.91 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.77 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.01 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.01 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.82 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  26.11 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.79 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  28.24 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>