60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1200 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  92.92 
 
 		 367 aa  701    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  93.46 
 
 		 367 aa  707    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 		 367 aa  750    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  69.48 
 
 		 367 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  51.79 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  47.68 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.77 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.01 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  35.5 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  35.5 
 
 		 408 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  29.62 
 
 		 410 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.47 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.47 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.79 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  24.56 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  20.91 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.01 
 
 		 462 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  23.02 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  23.02 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  27.49 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  23.5 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  26.61 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  26.61 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.29 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  28.38 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.83 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.58 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.68 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  30.53 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  22.83 
 
 		 465 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  23.74 
 
 		 456 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  25.53 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.26 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  24.02 
 
 		 454 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  29.9 
 
 		 457 aa  46.6  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  24.02 
 
 		 454 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  29.47 
 
 		 454 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  23.86 
 
 		 456 aa  46.2  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  28.42 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  28.18 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  22.65 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  25.9 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  24.51 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  24.85 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  23.08 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  25.98 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  25.6 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  22.3 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  28.42 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.93 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  23.47 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  21.95 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  25.2 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  28.57 
 
 		 458 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  24.8 
 
 		 455 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  21.88 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  21.76 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.12 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  33.8 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  39.58 
 
 		 470 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>