50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5783 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 420 aa  843    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  50.24 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  49.76 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  38.93 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  38.93 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.09 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.69 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.44 
 
 		 370 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.01 
 
 		 367 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.57 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.09 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  24.8 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  26.67 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  25.2 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.18 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  20.22 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  24.07 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  24.22 
 
 		 383 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  24.34 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  23.3 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  25.45 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.67 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  23.39 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  26.26 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  25.72 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  25.65 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  25 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.69 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  23.36 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.13 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.11 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  26.94 
 
 		 861 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.47 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  30.41 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.12 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.79 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  26.04 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  26.13 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.18 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  27.51 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  27.78 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.8 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  28.57 
 
 		 865 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  23.88 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.19 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  24.74 
 
 		 360 aa  43.5  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.98 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.98 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  25.77 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>