19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0909 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 
412 aa  850    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  56.02 
 
 
410 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  50.24 
 
 
420 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  41.46 
 
 
408 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  41.22 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.93 
 
 
367 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.56 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.79 
 
 
367 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.94 
 
 
367 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.07 
 
 
366 aa  163  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.21 
 
 
370 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.07 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  24.46 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  26.63 
 
 
363 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.54 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  26.06 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  25.85 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.11 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  22.71 
 
 
385 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>