46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1422 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 
367 aa  755    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  69.21 
 
 
367 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  68.66 
 
 
367 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  69.48 
 
 
367 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  48.76 
 
 
370 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  46.83 
 
 
366 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 
420 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.36 
 
 
412 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  33.97 
 
 
408 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  33.46 
 
 
408 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  34.68 
 
 
410 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.19 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.03 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.18 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.18 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  20 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  23.66 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  24.35 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.73 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  25 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  25 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.33 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  25 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.2 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
327 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  21.68 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  33.87 
 
 
460 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.88 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  33.33 
 
 
455 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  38.03 
 
 
460 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  30.53 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  24.02 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  30.85 
 
 
454 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  25 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  25.26 
 
 
374 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.16 
 
 
382 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  23.05 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  24.71 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.27 
 
 
374 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.27 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>