15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1454 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  814    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  56.02 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.76 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  38.31 
 
 		 408 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  38.06 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.58 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.5 
 
 		 367 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.6 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.5 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.76 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.38 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  35.16 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.29 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  24.44 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.47 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>