63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1693 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1693  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 
366 aa  745    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1624  glutamate--cysteine ligase, GCS2  56.04 
 
 
370 aa  421  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0322257 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.23 
 
 
367 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0474  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.96 
 
 
367 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  47.68 
 
 
367 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1422  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.83 
 
 
367 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.57 
 
 
420 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0909  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.52 
 
 
412 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.237663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  33.23 
 
 
408 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  35.07 
 
 
408 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1454  hypothetical protein  29.67 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.93 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  24.87 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.37 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  30 
 
 
861 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.42 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  28.68 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  24.4 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  26.23 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.56 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.83 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.78 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.76 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  26.2 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  25.16 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  26.15 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.84 
 
 
378 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  26.67 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.37 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  26.71 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  26.05 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  26.05 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  24.53 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  25.19 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  31.07 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  23.28 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  23.28 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  30 
 
 
850 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  25.51 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  24.49 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  23.9 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  23.28 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  24.64 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  25.62 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  27.47 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  25.33 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.5 
 
 
1318 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770518  decreased coverage  0.00818473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  26.67 
 
 
379 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  24 
 
 
380 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  31.08 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8101  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  37.25 
 
 
1327 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331826  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  21.99 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  30.93 
 
 
454 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.24 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.58 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  28.81 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  25 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.43 
 
 
375 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.79 
 
 
373 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  27.01 
 
 
454 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  28.18 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.85 
 
 
375 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>