136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2204 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  98.95 
 
 
380 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  100 
 
 
380 aa  784    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  73.44 
 
 
384 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  68.45 
 
 
379 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  67.28 
 
 
379 aa  547  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1837  glutamate/cysteine ligase  68.27 
 
 
382 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  65.26 
 
 
383 aa  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  65.68 
 
 
384 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1932  glutamate--cysteine ligase, putative  54.52 
 
 
380 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1148  hypothetical protein  51.09 
 
 
379 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20221  hypothetical protein  50.82 
 
 
379 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.574897  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22731  hypothetical protein  51.78 
 
 
380 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16961  hypothetical protein  50.96 
 
 
378 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0397  glutamate--cysteine ligase, putative  53.62 
 
 
386 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17671  hypothetical protein  45.9 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1668  hypothetical protein  46.03 
 
 
372 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.589825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17631  hypothetical protein  45.21 
 
 
372 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17831  hypothetical protein  46.17 
 
 
369 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  25.95 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  26.97 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  26.4 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.77 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.64 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  27.85 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  24.81 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  24.54 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  28.1 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  24.18 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.64 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  26.1 
 
 
382 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  28.37 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  30.41 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  22.08 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.71 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.78 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.43 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.7 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  21.32 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.84 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  28.06 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  28.74 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.21 
 
 
390 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  26.56 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  26.56 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  26.56 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.36 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.8 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.28 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.45 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.08 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  25.83 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  25.51 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.28 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  27.61 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  25.28 
 
 
383 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  27.91 
 
 
365 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.58 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
399 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  24.22 
 
 
370 aa  56.2  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  25 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  30.28 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  25.82 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  31.3 
 
 
850 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.8 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  23.3 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  28.39 
 
 
376 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.33 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  29.25 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  25.37 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.3 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.18 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  24.49 
 
 
377 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  27.89 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  25.36 
 
 
383 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.16 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.65 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  25.17 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.97 
 
 
374 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  24.47 
 
 
383 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.55 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  26.11 
 
 
861 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  22.89 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.02 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  27.27 
 
 
865 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  22.89 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  24.14 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1200  glutamate--cysteine ligase, GCS2  23.02 
 
 
367 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.827115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0445  hypothetical protein  37.7 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  23.81 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  26.92 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  22.97 
 
 
410 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  22.89 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.04 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0421  hypothetical protein  39.34 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.59 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  24.3 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  22.15 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  25.19 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>