144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0242 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  100 
 
 		 383 aa  796    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  68.87 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  65.53 
 
 		 380 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  65.26 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  62.99 
 
 		 379 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  61.1 
 
 		 379 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1837  glutamate/cysteine ligase  65 
 
 		 382 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  61.6 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1932  glutamate--cysteine ligase, putative  50.27 
 
 		 380 aa  359  4e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22731  hypothetical protein  48.11 
 
 		 380 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20221  hypothetical protein  48.25 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.574897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1148  hypothetical protein  47.98 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16961  hypothetical protein  48.11 
 
 		 378 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17671  hypothetical protein  44.99 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17631  hypothetical protein  43.4 
 
 		 372 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0397  glutamate--cysteine ligase, putative  48.65 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1668  hypothetical protein  43.94 
 
 		 372 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.589825  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17831  hypothetical protein  43.9 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.39 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  24.05 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  26.27 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.81 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.69 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  25.35 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.7 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.54 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  24.03 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  24.51 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.54 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  23.69 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  22.52 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.19 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  23.55 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.19 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  24.81 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  24.27 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.19 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.42 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  23.74 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  25.91 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.2 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  25.21 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.2 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  24.44 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  24.44 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  24.44 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.32 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  23.72 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.93 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.58 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  25.37 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  30 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.22 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  23.73 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  22.73 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.1 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.22 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  28.36 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  31.33 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.61 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  22.79 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  23.79 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  32.33 
 
 		 850 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.33 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.1 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  26.45 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  21.73 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.36 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  19.85 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.76 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  23.01 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.4 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.94 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  24.79 
 
 		 861 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  24.79 
 
 		 865 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  22.79 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  23.7 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  21.74 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  20.93 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.22 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  23.37 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.21 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  22.18 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  22.99 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.45 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.12 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  25 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  22.27 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.79 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  24.49 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  21.54 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  24.82 
 
 		 372 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.7 
 
 		 382 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>