169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3193 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  100 
 
 
379 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  79.31 
 
 
379 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  68.45 
 
 
380 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  67.91 
 
 
380 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  67.46 
 
 
384 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1837  glutamate/cysteine ligase  69.6 
 
 
382 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  62.99 
 
 
383 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  64.15 
 
 
384 aa  499  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1932  glutamate--cysteine ligase, putative  55.98 
 
 
380 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22731  hypothetical protein  54.59 
 
 
380 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1148  hypothetical protein  52.69 
 
 
379 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16961  hypothetical protein  52.88 
 
 
378 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20221  hypothetical protein  52.15 
 
 
379 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.574897  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0397  glutamate--cysteine ligase, putative  55.19 
 
 
386 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1668  hypothetical protein  46.3 
 
 
372 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.589825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17631  hypothetical protein  45.81 
 
 
372 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17671  hypothetical protein  45.76 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17831  hypothetical protein  45.53 
 
 
369 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  25.46 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.49 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.32 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  27.69 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  29.41 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.8 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.62 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  27.04 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  25.48 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.91 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.81 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.51 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  24.32 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  25.23 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  26.69 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.2 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  23.38 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  27.8 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.51 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  28.33 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  25.11 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  27.85 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.58 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.07 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.16 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  27.69 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  27.69 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  27.69 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.48 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  26.36 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  28.15 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  30.81 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  25.26 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  28.28 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  27.31 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.46 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.72 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.33 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  25.49 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  26.62 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.52 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.33 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.59 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.56 
 
 
362 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 
360 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  30.3 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  23.19 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  25.08 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  26.25 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  24.69 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  26.72 
 
 
861 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.13 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  26.73 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  25.82 
 
 
375 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5783  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.67 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  29.08 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.73 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  26.49 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.88 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.1 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  23.86 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  30.77 
 
 
865 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  25.81 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  25.81 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  25.81 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  25.81 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  25.54 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  28.95 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  27.11 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  25.54 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.23 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  25 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  28.36 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  24.05 
 
 
373 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  22.97 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  27.86 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.57 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.73 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  21.61 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>