136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0214 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  91.63 
 
 		 454 aa  795    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  68.42 
 
 		 456 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  71.27 
 
 		 456 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  68.85 
 
 		 459 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  91.41 
 
 		 454 aa  831    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 454 aa  917    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  71.71 
 
 		 456 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  59.17 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  56.19 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  54.81 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  57.94 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  58.17 
 
 		 454 aa  508  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  54.14 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  55.26 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  54.36 
 
 		 456 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  53.59 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  53.24 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  55.51 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  52.57 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  53.02 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  55.28 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  54.42 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  57.75 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  55.51 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  54.3 
 
 		 452 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  53.71 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  54.08 
 
 		 455 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  50.44 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  51.69 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  51.22 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  49.78 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  54.07 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  49.66 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  52.19 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  49.67 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  46.61 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  52.97 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  49.45 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  52.31 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  52.31 
 
 		 456 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  49.22 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  48.78 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  47.59 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  52.91 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  46.28 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  53.69 
 
 		 455 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  53.22 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  50.23 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  46.83 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  44.96 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  43.42 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  43.36 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  43.42 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  43.06 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  38.85 
 
 		 451 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  35.84 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  30.14 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  29.25 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.84 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.43 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  28.26 
 
 		 432 aa  172  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  32.36 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.83 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  34.01 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  31.42 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.11 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  34.44 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  33.47 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.58 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  33.21 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.74 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.74 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.74 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.55 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.84 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.58 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.26 
 
 		 366 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.9 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.3 
 
 		 410 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  26.3 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  33.06 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  28.96 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  33.54 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.65 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  28.22 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  29.34 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  27.21 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.83 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.2 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.01 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  31.88 
 
 		 865 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  27.78 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.45 
 
 		 382 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  31.88 
 
 		 861 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.75 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.49 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.7 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.48 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>