108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0658 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 456 aa  941    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  64.62 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  63.31 
 
 		 454 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  63.17 
 
 		 456 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  62.42 
 
 		 454 aa  584  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  62.5 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  62.95 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  63.17 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  63.39 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  63.39 
 
 		 456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  62.95 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  61.3 
 
 		 456 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  61.3 
 
 		 456 aa  571  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  61.07 
 
 		 456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  60.09 
 
 		 455 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  58.71 
 
 		 457 aa  562  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  58.96 
 
 		 459 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  58.61 
 
 		 454 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  60 
 
 		 456 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  60.44 
 
 		 460 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  58.39 
 
 		 454 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  59.56 
 
 		 457 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  60.04 
 
 		 455 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  59.17 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  61.28 
 
 		 456 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  60.09 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  58.11 
 
 		 460 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  57.21 
 
 		 457 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  57.11 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  55.23 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  56.32 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  57.91 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  57.21 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  57.59 
 
 		 456 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  57.02 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  56.19 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  55.58 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  57.33 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  55.36 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  57.59 
 
 		 455 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  54.76 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  51.79 
 
 		 457 aa  481  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  53.23 
 
 		 457 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  57.37 
 
 		 455 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  51.8 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  49.22 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  55.58 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  52.6 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  47.82 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  49.13 
 
 		 470 aa  398  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.54 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  39.08 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  38.62 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  38.76 
 
 		 453 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  38.5 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  37.84 
 
 		 462 aa  263  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  28.57 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  27.7 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.56 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  28.34 
 
 		 427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.44 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.06 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.92 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  31.49 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  30.87 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  29.69 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.69 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.62 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.96 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.96 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.96 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  31.52 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.27 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  29.66 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.02 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.38 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.18 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  30 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.93 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  28.92 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.83 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  30.16 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.97 
 
 		 388 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.67 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.24 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.43 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  31.03 
 
 		 382 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.97 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.08 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.44 
 
 		 378 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  26.37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  29.93 
 
 		 865 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.61 
 
 		 375 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  29.5 
 
 		 861 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.11 
 
 		 375 aa  47  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.11 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.11 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  25.68 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.29 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  28.04 
 
 		 850 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>