84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4142 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  100 
 
 
451 aa  915    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  43.19 
 
 
453 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  41.4 
 
 
453 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  42.12 
 
 
457 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  40.71 
 
 
455 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  39.77 
 
 
465 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  40.95 
 
 
453 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  41.49 
 
 
454 aa  295  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  39.86 
 
 
456 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  40.95 
 
 
453 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  41.92 
 
 
460 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  40.6 
 
 
454 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  40.74 
 
 
454 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  40.33 
 
 
456 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  39.68 
 
 
454 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  39.6 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  40.32 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  39.63 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  37.93 
 
 
484 aa  282  9e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  37.59 
 
 
457 aa  281  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  37.56 
 
 
457 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  39.09 
 
 
456 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  38.95 
 
 
456 aa  279  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  38.93 
 
 
456 aa  279  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  40.87 
 
 
456 aa  279  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  39.54 
 
 
456 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  40.19 
 
 
460 aa  276  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  37.44 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  42.03 
 
 
457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  37.79 
 
 
457 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  40.85 
 
 
452 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  38.85 
 
 
454 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  38.56 
 
 
459 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  37.56 
 
 
457 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  38.85 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  38.55 
 
 
460 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  38.5 
 
 
456 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  40.14 
 
 
455 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  37.85 
 
 
457 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  38.46 
 
 
456 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  40.37 
 
 
456 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  40.09 
 
 
456 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  40.14 
 
 
456 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  38.93 
 
 
456 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  42.9 
 
 
454 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  38.41 
 
 
457 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  38.23 
 
 
456 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  37.75 
 
 
457 aa  253  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  38.63 
 
 
458 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  38.92 
 
 
457 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  37.5 
 
 
455 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  38.21 
 
 
457 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  39.59 
 
 
455 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  37.95 
 
 
455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  35.59 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  31.35 
 
 
393 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  29.44 
 
 
443 aa  163  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  27.83 
 
 
432 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.76 
 
 
429 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.37 
 
 
425 aa  142  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  27.95 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  25.74 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  33.06 
 
 
445 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  36.03 
 
 
399 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  31.32 
 
 
432 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.2 
 
 
448 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.1 
 
 
424 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.1 
 
 
424 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.1 
 
 
424 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.97 
 
 
424 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  31.72 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.91 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.37 
 
 
366 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  33.06 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  33.61 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.33 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.29 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  30.96 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.63 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  33.2 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.04 
 
 
502 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.16 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1463  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.24 
 
 
311 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.800813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  26.39 
 
 
380 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>