32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1463 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1463  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 
311 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.800813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  28.24 
 
 
451 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  27.72 
 
 
443 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  26.46 
 
 
445 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  27.52 
 
 
470 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  26.67 
 
 
448 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.44 
 
 
502 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  26.89 
 
 
399 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  25.71 
 
 
484 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  27.06 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.38 
 
 
424 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  24.04 
 
 
458 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  29.32 
 
 
428 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  24.71 
 
 
456 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  25.63 
 
 
457 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  26.09 
 
 
455 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  28 
 
 
366 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  25.3 
 
 
462 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  24.9 
 
 
454 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  24.9 
 
 
454 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  25.1 
 
 
456 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  24.34 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  26.69 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  24.81 
 
 
460 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  25.29 
 
 
453 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  27.33 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  26.04 
 
 
457 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.29 
 
 
453 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  23.46 
 
 
454 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  26 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  28.57 
 
 
373 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  25.59 
 
 
452 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>