84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3936 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  100 
 
 
453 aa  904    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  98.23 
 
 
453 aa  892    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  95.58 
 
 
453 aa  870    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  74.61 
 
 
453 aa  700    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  42.86 
 
 
457 aa  347  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  40.95 
 
 
454 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  45.41 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  45.18 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  44.95 
 
 
456 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  40.5 
 
 
454 aa  336  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  42.79 
 
 
456 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  42.92 
 
 
456 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  42.24 
 
 
456 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  40.86 
 
 
454 aa  332  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  42.01 
 
 
456 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  43.75 
 
 
460 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  41.34 
 
 
465 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  42.08 
 
 
459 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  43.39 
 
 
455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  42.01 
 
 
456 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  42.6 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  43.42 
 
 
454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  44.39 
 
 
455 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  41.47 
 
 
456 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  40.77 
 
 
454 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  40.68 
 
 
456 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  40.55 
 
 
456 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  41.42 
 
 
456 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  41.19 
 
 
456 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  40.69 
 
 
456 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  41.28 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  38.62 
 
 
456 aa  312  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  42.26 
 
 
454 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  42.82 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  40.96 
 
 
457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  45.37 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  38.91 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  43.09 
 
 
455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  44.44 
 
 
455 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  40.05 
 
 
457 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  42.26 
 
 
454 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  39.22 
 
 
457 aa  299  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  38.69 
 
 
457 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  43 
 
 
458 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  38.69 
 
 
457 aa  296  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  40.95 
 
 
451 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  41.12 
 
 
460 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  40.59 
 
 
457 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  40.36 
 
 
457 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  38.91 
 
 
457 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  36.96 
 
 
457 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  39.43 
 
 
460 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  38.44 
 
 
470 aa  276  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  36.03 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  37.5 
 
 
462 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  33.03 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  30.03 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  31.06 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  26.25 
 
 
432 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.22 
 
 
425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  27.38 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.84 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  32.82 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.21 
 
 
366 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.57 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.57 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.57 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  35.11 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.92 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.23 
 
 
424 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.05 
 
 
410 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  35.12 
 
 
445 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  37.92 
 
 
418 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.44 
 
 
448 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  35.39 
 
 
428 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.33 
 
 
408 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  35.63 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  34.22 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.88 
 
 
502 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  33.59 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.98 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.56 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  27.56 
 
 
410 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1463  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.29 
 
 
311 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.800813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>