110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2845 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  75.6 
 
 		 456 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  76.47 
 
 		 456 aa  729    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 459 aa  940    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  68.85 
 
 		 454 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  76.69 
 
 		 456 aa  744    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  69.28 
 
 		 454 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  69.5 
 
 		 454 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  58.96 
 
 		 456 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  59.21 
 
 		 457 aa  558  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  59.35 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  58.26 
 
 		 454 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  57.3 
 
 		 456 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  58.44 
 
 		 454 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  58.44 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  60.22 
 
 		 460 aa  524  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  59.56 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  56.76 
 
 		 452 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  55.88 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  54.66 
 
 		 455 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  53.98 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  57.86 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  53.98 
 
 		 456 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  53.1 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  53.76 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  52.99 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  52.88 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  52.88 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  57.3 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  52.77 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  51.75 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  52.77 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  52.55 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  52.32 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  52.36 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  51.75 
 
 		 457 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  51.32 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  52.65 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  49.67 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  51.2 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  52.43 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  52.32 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  49.34 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  47.42 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  52.33 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  48.65 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  53.36 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  52.93 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  52.61 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  47.51 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  47.87 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  43.32 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  42.53 
 
 		 453 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.31 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  42.08 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  38.56 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  35.71 
 
 		 462 aa  253  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  29.77 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  28.7 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  33.33 
 
 		 429 aa  177  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.68 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  27.84 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.22 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  31.86 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  32.22 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.12 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.16 
 
 		 424 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.27 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  34.44 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  36.08 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.79 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.42 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.42 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.42 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  34.85 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.44 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.8 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  31.14 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  29.25 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.55 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.08 
 
 		 366 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.51 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  29.17 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  34.88 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.5 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  26.44 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.65 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  26.77 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  26.77 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  26.77 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  28.48 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.21 
 
 		 379 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  23.94 
 
 		 379 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.43 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  25.75 
 
 		 378 aa  47.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  25 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  23.94 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.61 
 
 		 366 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  28.65 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.87 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>