83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0485 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0763  glutamate--cysteine ligase  71.77 
 
 
457 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0373  glutamate--cysteine ligase  71.55 
 
 
457 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0645412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0711  glutamate--cysteine ligase  71.55 
 
 
457 aa  687    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0387  glutamate--cysteine ligase  80.31 
 
 
457 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2998  glutamate--cysteine ligase  71.55 
 
 
457 aa  697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0441  glutamate/cysteine ligase  95.62 
 
 
457 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5779  glutamate--cysteine ligase  70.9 
 
 
457 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0485  glutamate/cysteine ligase  100 
 
 
457 aa  949    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395178  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0301  glutamate--cysteine ligase  61.05 
 
 
457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4204  glutamate--cysteine ligase  59.35 
 
 
456 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0732  glutamate--cysteine ligase  56.67 
 
 
456 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0658  glutamate--cysteine ligase  56.19 
 
 
456 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0820  gamma-glutamylcysteine synthetase (glutamate--cysteine ligase)  55.43 
 
 
456 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0890  glutamate/cysteine ligase  56.3 
 
 
456 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4597  glutamate--cysteine ligase  56.02 
 
 
456 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4332  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0810  glutamate--cysteine ligase  56.52 
 
 
456 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0250  glutamate--cysteine ligase  55.36 
 
 
456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0182  glutamate--cysteine ligase  54.35 
 
 
456 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397427  normal  0.417988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2240  glutamate--cysteine ligase  54.79 
 
 
457 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011695  normal  0.0502756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0828  glutamate--cysteine ligase  55.97 
 
 
456 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500638  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2251  glutamate--cysteine ligase  55.41 
 
 
460 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0861  glutamate/cysteine ligase  55.75 
 
 
456 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.757584  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0901  glutamate--cysteine ligase  55.75 
 
 
456 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3398  glutamate/cysteine ligase  54.34 
 
 
454 aa  491  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.135789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1207  glutamate--cysteine ligase  54.69 
 
 
455 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0828258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5994  glutamate--cysteine ligase  58.33 
 
 
455 aa  485  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1833  glutamate/cysteine ligase  53.23 
 
 
460 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0814338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3097  glutamate-cysteine ligase  52.1 
 
 
456 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104842  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2845  glutamate--cysteine ligase  51.32 
 
 
459 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0570  glutamate--cysteine ligase  53.71 
 
 
456 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214516  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3076  glutamate--cysteine ligase  51.43 
 
 
456 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0372  glutamate--cysteine ligase  54.05 
 
 
452 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5385  glutamate--cysteine ligase  55.22 
 
 
455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768023  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04428  glutamate--cysteine ligase  51.88 
 
 
454 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7293  glutamate/cysteine ligase  57.36 
 
 
455 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0687  glutamate--cysteine ligase  51.11 
 
 
454 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.637263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1724  glutamate--cysteine ligase  52.68 
 
 
455 aa  455  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0214  glutamate--cysteine ligase  48.78 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0775  glutamate-cysteine ligase precursor  50.67 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3909  glutamate--cysteine ligase  50.33 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2364  glutamate--cysteine ligase  53.79 
 
 
456 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.499784  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2665  glutamate--cysteine ligase  49.22 
 
 
454 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0377475  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0949  glutamate--cysteine ligase  52.16 
 
 
457 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2277  glutamate--cysteine ligase  51.7 
 
 
460 aa  425  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3679  glutamate--cysteine ligase  48.23 
 
 
465 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1875  glutamate--cysteine ligase  51.76 
 
 
458 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00894076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1005  putative glutathione synthetase  49.22 
 
 
454 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.231672  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41198  gamma-glutamate cysteine synthase  46.47 
 
 
484 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71249  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3114  glutamate/cysteine ligase  49.57 
 
 
470 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459185  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04425  glutamate--cysteine ligase  43.14 
 
 
393 aa  353  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3850  Glutamate--cysteine ligase  40.36 
 
 
453 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.926408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3936  Glutamate--cysteine ligase  40.36 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3793  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.36 
 
 
453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3913  glutamate--cysteine ligase  37.78 
 
 
453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.510205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4142  Glutamate--cysteine ligase  38.21 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423627  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3126  gamma-glutamylcysteine synthetase  35.29 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08400  Glutamate--cysteine ligase  30.27 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0135  Glutamate--cysteine ligase  28.27 
 
 
432 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00996441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2348  Glutamate--cysteine ligase  30.07 
 
 
427 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04720  gamma-glutamylcysteine synthetase  30.52 
 
 
425 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13600  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.95 
 
 
429 aa  152  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1932  gamma-glutamylcysteine synthetase  29.1 
 
 
425 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13735  glutamate-cysteine ligase gshA  29.86 
 
 
432 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.444818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8028  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.97 
 
 
366 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1082  glutamate/cysteine ligase family protein  33.07 
 
 
445 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.611657  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5486  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.45 
 
 
424 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175702  normal  0.084179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1315  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.51 
 
 
448 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0205  glutamate/cysteine ligase family protein  29.83 
 
 
418 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3641  glutamate/cysteine ligase family protein  31.6 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5250  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.66 
 
 
424 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.946516  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4971  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.66 
 
 
424 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4882  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.66 
 
 
424 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4511  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.6 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20874  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2256  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.15 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2113  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.87 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0416635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22470  gamma-glutamylcysteine synthetase  28.97 
 
 
428 aa  86.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7300  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.32 
 
 
472 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.038587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0332  glutamate/cysteine ligase  31.33 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288662  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2122  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.92 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5168  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.34 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0637  glutamate/cysteine ligase family protein  31.58 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2651  glutamate/cysteine ligase family protein  28.36 
 
 
373 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1434  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.25 
 
 
367 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.182989  normal  0.07696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>